هم زمان با هفته پژوهش و فناوری، از جامعترین پایگاه داده miRNA در سرطان رونمایی شد
به گزارش روابط عمومی و امور بینالملل پژوهشگاه رویان، همزمان با هفته ملی پژوهش و فناوری، شرکت «زیستفناوری میراث» که در حوزه الیگونوکلئوتیدها از جمله مولکولهای miRNA فعالیت میکند، از جامعترین پایگاه داده miRNA در سرطان تحت عنوان نامیرا (namiRa) رونمایی کرد.
در این مراسم که با حضور معاون تحقیقات و فناوری وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی برگزار شد، مدیرعامل شرکت زیستفناوری میراث که از شرکتهای مستقر در مرکز رشد زیستفناوری رویان است، به معرفی این پایگاه بینالمللی پرداخت. دکتر شریف مرادی، عضو هیأت علمی پژوهشگاه رویان، بنیانگذار و مدیرعامل شرکت زیستفناوری میراث در اینباره گفت: واژه نامیرا برگرفته از «میر» یا همان miRNA و نامیرابودنِ سرطان است، چرا که سلولهای سرطانی سلولهای پرتکثیر و نامیرایی هستند که طی تقسیمهای سلولی متوالی به طور مرتب تعداد خود را افزایش میدهند. این پایگاه دادۀ بینالمللی، وضعیت بیانی (یعنی غلظت miRNA) و عملکرد تنظیمیِ تعداد ۱۱۱۰ مولکول مختلف miRNA را در ۳۵ نوع سرطان ارائه مینماید که ماحصل کاوش اطلاعات حدود ده هزار مقاله علمی بینالمللی طی مدت پنج سال است.
ایشان افزود: محققان حوزه miRNA و سرطان میتوانند جستجوی خود را از سه طریق در پایگاه داده نامیرا به آدرس www. namiRa-db. com که جامعترین پایگاه داده miRNA در دنیا است، انجام دهند؛ براساس نوع سرطان، یا براساس نام miRNA موردنظر و یا هر دو (هم miRNA هم نوع سرطان). با انجام این جستجو، اساتید، محققان و دانشجویان حوزه سرطان میتوانند به همه جزئیات و اطلاعات miRNA مدنظر خود در انواع سرطان دست پیدا کنند؛ از جمله اینکه آیا فلان مولکول miRNA در سلول، بافت و یا نمونه توموری بیمار الگوی بیانی کاهشی دارد یا افزایشی؟ با چه روشی (qRT-PCR, Microarray, Small RNA Sequencing) این miRNA شناسایی شده است؟ نتایج آنالیز عملکردی این miRNA چه بوده است؟ این miRNA کدام پدیده بیولوژیکی (آپوپتوز، تکثیر سلولی، زندهمانی، مقاومت شیمیدرمانی، توقف چرخه سلولی و یا متاستاز سرطان) را پیش میبرد و کدام را مهار میکند؟ نتیجه جستجوی محققان در این پایگاه داده، جزئیات کامل آنالیزهای عملکردی مرتبط با miRNA را هم در مطالعات سلولی (in-vitro) و هم در مطالعات حیوانی (in-vivo) ارائه مینماید، ضمن این که ژنهای هدف miRNA موردنظر و یکسری اطلاعات مهم دیگر نیز قابل مشاهده خواهد بود.
بخش مهم پایگاه داده، ارائه یک شبکه تنظیم ژنی دقیق برای هر مولکول miRNA در هر نوع سرطان موردجستجو است. این نقشه شماتیک به صورت خودکار و ماشینی، توسط پایگاه داده تولید میشود و در دو فرمت «تصویر JPG» یا «پیدیاف» توسط محققان قابلدانلود است.
در این مراسم که با حضور معاون تحقیقات و فناوری وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی برگزار شد، مدیرعامل شرکت زیستفناوری میراث که از شرکتهای مستقر در مرکز رشد زیستفناوری رویان است، به معرفی این پایگاه بینالمللی پرداخت. دکتر شریف مرادی، عضو هیأت علمی پژوهشگاه رویان، بنیانگذار و مدیرعامل شرکت زیستفناوری میراث در اینباره گفت: واژه نامیرا برگرفته از «میر» یا همان miRNA و نامیرابودنِ سرطان است، چرا که سلولهای سرطانی سلولهای پرتکثیر و نامیرایی هستند که طی تقسیمهای سلولی متوالی به طور مرتب تعداد خود را افزایش میدهند. این پایگاه دادۀ بینالمللی، وضعیت بیانی (یعنی غلظت miRNA) و عملکرد تنظیمیِ تعداد ۱۱۱۰ مولکول مختلف miRNA را در ۳۵ نوع سرطان ارائه مینماید که ماحصل کاوش اطلاعات حدود ده هزار مقاله علمی بینالمللی طی مدت پنج سال است.
ایشان افزود: محققان حوزه miRNA و سرطان میتوانند جستجوی خود را از سه طریق در پایگاه داده نامیرا به آدرس www. namiRa-db. com که جامعترین پایگاه داده miRNA در دنیا است، انجام دهند؛ براساس نوع سرطان، یا براساس نام miRNA موردنظر و یا هر دو (هم miRNA هم نوع سرطان). با انجام این جستجو، اساتید، محققان و دانشجویان حوزه سرطان میتوانند به همه جزئیات و اطلاعات miRNA مدنظر خود در انواع سرطان دست پیدا کنند؛ از جمله اینکه آیا فلان مولکول miRNA در سلول، بافت و یا نمونه توموری بیمار الگوی بیانی کاهشی دارد یا افزایشی؟ با چه روشی (qRT-PCR, Microarray, Small RNA Sequencing) این miRNA شناسایی شده است؟ نتایج آنالیز عملکردی این miRNA چه بوده است؟ این miRNA کدام پدیده بیولوژیکی (آپوپتوز، تکثیر سلولی، زندهمانی، مقاومت شیمیدرمانی، توقف چرخه سلولی و یا متاستاز سرطان) را پیش میبرد و کدام را مهار میکند؟ نتیجه جستجوی محققان در این پایگاه داده، جزئیات کامل آنالیزهای عملکردی مرتبط با miRNA را هم در مطالعات سلولی (in-vitro) و هم در مطالعات حیوانی (in-vivo) ارائه مینماید، ضمن این که ژنهای هدف miRNA موردنظر و یکسری اطلاعات مهم دیگر نیز قابل مشاهده خواهد بود.
بخش مهم پایگاه داده، ارائه یک شبکه تنظیم ژنی دقیق برای هر مولکول miRNA در هر نوع سرطان موردجستجو است. این نقشه شماتیک به صورت خودکار و ماشینی، توسط پایگاه داده تولید میشود و در دو فرمت «تصویر JPG» یا «پیدیاف» توسط محققان قابلدانلود است.
تاریخ انتشار: ۱۴۰۳/۰۹/۲۸